ASE라이브러리2 [파이썬 실전] 수백 개의 분자 및 결정 구조 파일 확장자 일괄 변환 자동화 스크립트 (.xyz, .cif, POSCAR) 지난 포스팅에서는 계산 화학과 신소재 연구의 퀄리티를 높여주는 3대 시각화 프로그램(Avogadro, VESTA, PyMOL)의 활용법을 알아보았습니다. 하지만 이 프로그램들을 능수능란하게 다루기 전에 연구자들이 반드시 넘어야 할 산이 있습니다. 바로 '파일 포맷(Format)의 불일치'입니다. 아보가드로는 3차원 좌표만 있는 '.xyz' 파일을 주로 다루지만, VESTA는 주기적 경계 조건(PBC)이 포함된 '.cif' 파일을 선호하며, 실제 슈퍼컴퓨터에서 VASP 시뮬레이션을 돌리기 위해서는 'POSCAR'라는 특수한 텍스트 포맷이 필요합니다. 머신러닝으로 생성해 낸 수천 개의 새로운 분자 구조 파일(.xyz)을 시뮬레이션용 포맷으로 마우스 클릭을 통해 일일이 바꾸는 것은 물리적으로 불가능합니다. 이.. 2026. 4. 22. [연구 자동화] 파이썬(Python)과 ASE를 활용한 계산 화학 시뮬레이션 입력 파일 자동 생성 및 결과 분석 실전 이전 포스팅에서는 다중 물리 시뮬레이션의 속도 향상을 위한 병렬 컴퓨팅의 원리와 스크립트 최적화의 전반적인 개념에 대해 알아보았습니다. 이번 글에서는 한 걸음 더 나아가, 실제 계산 화학 및 나노 소재 연구 현장에서 즉시 적용할 수 있는 파이썬(Python) 기반의 실전 자동화 스크립트 구축 방법에 대해 심도 있게 다루어 보겠습니다. 특히 수십에서 수백 개의 원자로 이루어진 금속유기골격체(MOFs)나 거대한 나노 입자의 거동을 분석할 때, 수작업으로 모델링을 진행하고 입력(Input) 파일을 만드는 것은 엄청난 시간 낭비이자 오류의 원인이 됩니다. 이를 극복하기 위해 파이썬의 강력한 라이브러리인 ASE(Atomic Simulation Environment)를 활용하여 시뮬레이션 워크플로우를 완벽하게 제어.. 2026. 4. 21. 이전 1 다음